Innerhalb der Bio-Informatik sind alle Maschinen, sowohl Server als auch Workstations, auf Debian standardisiert. Dies geschah im Allgemeinen aufgrund des hohen Grades an verfügbarer Unterstützung für Debian und der vereinfachten Administration die das Debian-Paketverwaltungssystem bietet. Ein geringerer, aber dennoch bedeutender Grund ist die Sorgfalt und Qualitätsüberprüfung, die die meisten Betreuer ihren Pakete angedeihen lassen.